Protein–RNA interactions for Protein: O00458

IFRD1, Interferon-related developmental regulator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1O00458 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFRD1O00458 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFRD1O00458 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFRD1O00458 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFRD1O00458 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IFRD1O00458 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms