Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GFRA2O00451 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GFRA2O00451 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GFRA2O00451 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms