Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
O00370 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
O00370 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
O00370 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
O00370 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
O00370 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
O00370 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
O00370 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
O00370 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
O00370 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
O00370 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
O00370 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
O00370 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
O00370 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
O00370 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
O00370 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
O00370 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
O00370 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
O00370 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
O00370 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
O00370 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
O00370 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
O00370 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
O00370 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
O00370 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
O00370 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
O00370 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
O00370 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
O00370 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
O00370 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
O00370 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
O00370 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
O00370 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
O00370 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
O00370 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
O00370 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
O00370 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
O00370 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
O00370 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
O00370 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
O00370 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
O00370 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
O00370 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
O00370 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
O00370 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
O00370 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
O00370 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
O00370 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
O00370 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
O00370 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
O00370 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
O00370 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
O00370 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
O00370 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
O00370 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
O00370 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
O00370 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
O00370 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
O00370 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
O00370 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
O00370 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
O00370 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
O00370 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
O00370 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
O00370 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
O00370 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
O00370 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
O00370 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
O00370 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
O00370 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
O00370 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
O00370 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
O00370 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
O00370 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
O00370 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
O00370 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
O00370 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
O00370 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
O00370 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
O00370 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
O00370 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
O00370 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
O00370 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
O00370 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
O00370 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
O00370 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
O00370 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
O00370 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
O00370 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
O00370 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
O00370 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
O00370 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
O00370 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
O00370 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
O00370 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
O00370 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
O00370 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
O00370 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
O00370 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
O00370 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms