Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BM21 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BM21 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BM21 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BM21 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BM21 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BM21 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BM21 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BM21 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BM21 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BM21 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BM21 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BM21 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BM21 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BM21 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BM21 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BM21 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BM21 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BM21 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BM21 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BM21 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BM21 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BM21 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BM21 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BM21 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BM21 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BM21 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BM21 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BM21 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BM21 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BM21 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BM21 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BM21 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BM21 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BM21 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BM21 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BM21 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BM21 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BM21 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BM21 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BM21 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BM21 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BM21 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BM21 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BM21 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BM21 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BM21 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BM21 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BM21 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BM21 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BM21 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BM21 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BM21 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BM21 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BM21 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BM21 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BM21 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BM21 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BM21 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BM21 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BM21 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BM21 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BM21 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BM21 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BM21 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BM21 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BM21 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BM21 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BM21 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BM21 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BM21 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BM21 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BM21 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BM21 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BM21 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BM21 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BM21 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BM21 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BM21 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BM21 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BM21 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BM21 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BM21 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BM21 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BM21 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BM21 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BM21 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BM21 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BM21 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BM21 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H3BM21 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H3BM21 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
H3BM21 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H3BM21 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BM21 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BM21 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BM21 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BM21 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BM21 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BM21 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms