Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB8E9PQR5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NPIPB8E9PQR5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPIPB8E9PQR5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB8E9PQR5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms