Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E9PBE3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E9PBE3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E9PBE3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E9PBE3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E9PBE3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E9PBE3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E9PBE3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E9PBE3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PBE3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PBE3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PBE3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PBE3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PBE3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PBE3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PBE3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PBE3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PBE3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E9PBE3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PBE3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PBE3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PBE3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PBE3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PBE3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PBE3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PBE3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PBE3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PBE3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PBE3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E9PBE3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PBE3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PBE3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PBE3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PBE3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PBE3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PBE3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PBE3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PBE3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PBE3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E9PBE3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E9PBE3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E9PBE3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
E9PBE3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E9PBE3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E9PBE3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E9PBE3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E9PBE3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E9PBE3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E9PBE3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E9PBE3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E9PBE3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E9PBE3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E9PBE3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E9PBE3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E9PBE3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E9PBE3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E9PBE3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E9PBE3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E9PBE3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E9PBE3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E9PBE3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E9PBE3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E9PBE3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E9PBE3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E9PBE3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E9PBE3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E9PBE3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
E9PBE3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E9PBE3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E9PBE3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E9PBE3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E9PBE3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E9PBE3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E9PBE3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E9PBE3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E9PBE3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E9PBE3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E9PBE3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E9PBE3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E9PBE3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E9PBE3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E9PBE3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E9PBE3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E9PBE3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E9PBE3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PBE3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PBE3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PBE3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PBE3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
E9PBE3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
E9PBE3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
E9PBE3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PBE3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PBE3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PBE3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PBE3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PBE3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PBE3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PBE3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PBE3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms