Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B4DXG7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B4DXG7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B4DXG7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B4DXG7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B4DXG7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
B4DXG7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B4DXG7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
B4DXG7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B4DXG7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4DXG7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4DXG7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4DXG7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
B4DXG7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4DXG7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4DXG7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4DXG7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
B4DXG7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
B4DXG7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
B4DXG7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
B4DXG7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
B4DXG7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
B4DXG7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
B4DXG7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
B4DXG7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4DXG7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4DXG7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4DXG7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4DXG7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4DXG7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4DXG7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4DXG7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4DXG7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
B4DXG7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
B4DXG7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
B4DXG7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
B4DXG7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
B4DXG7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
B4DXG7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
B4DXG7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
B4DXG7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4DXG7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4DXG7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4DXG7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4DXG7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4DXG7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B4DXG7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B4DXG7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
B4DXG7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
B4DXG7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4DXG7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4DXG7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4DXG7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4DXG7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4DXG7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4DXG7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4DXG7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
B4DXG7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4DXG7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4DXG7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4DXG7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4DXG7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4DXG7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B4DXG7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B4DXG7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B4DXG7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
B4DXG7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
B4DXG7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
B4DXG7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
B4DXG7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B4DXG7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4DXG7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4DXG7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4DXG7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4DXG7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4DXG7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4DXG7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4DXG7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4DXG7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B4DXG7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
B4DXG7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B4DXG7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
B4DXG7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B4DXG7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B4DXG7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
B4DXG7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B4DXG7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4DXG7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4DXG7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4DXG7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4DXG7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4DXG7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4DXG7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4DXG7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
B4DXG7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4DXG7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4DXG7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4DXG7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4DXG7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4DXG7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms