Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PP2D1A8MPX8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PP2D1A8MPX8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PP2D1A8MPX8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms