Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms