Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NL46 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NL46 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NL46 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NL46 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NL46 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NL46 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NL46 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NL46 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NL46 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
A6NL46 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NL46 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NL46 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NL46 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NL46 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NL46 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NL46 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NL46 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A6NL46 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NL46 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NL46 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A6NL46 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NL46 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NL46 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NL46 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NL46 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NL46 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NL46 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NL46 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NL46 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NL46 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NL46 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A6NL46 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NL46 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NL46 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NL46 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NL46 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NL46 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NL46 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NL46 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NL46 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NL46 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A6NL46 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NL46 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NL46 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NL46 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NL46 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NL46 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NL46 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NL46 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NL46 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NL46 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A6NL46 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NL46 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NL46 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NL46 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NL46 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NL46 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NL46 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NL46 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NL46 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NL46 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A6NL46 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NL46 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NL46 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NL46 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NL46 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NL46 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NL46 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A6NL46 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NL46 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NL46 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NL46 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NL46 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NL46 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NL46 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NL46 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NL46 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NL46 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NL46 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NL46 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A6NL46 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A6NL46 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A6NL46 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A6NL46 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A6NL46 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NL46 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NL46 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NL46 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NL46 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NL46 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NL46 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NL46 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NL46 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NL46 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NL46 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NL46 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NL46 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NL46 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NL46 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms