Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDR42E2A6NKP2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDR42E2A6NKP2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDR42E2A6NKP2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDR42E2A6NKP2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms