Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIPT2A6NK58 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LIPT2A6NK58 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIPT2A6NK58 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.1 ms