Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPOPA6NHQ4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
EPOPA6NHQ4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPOPA6NHQ4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms