Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MEIS3P1A6NDR6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MEIS3P1A6NDR6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MEIS3P1A6NDR6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MEIS3P1A6NDR6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEIS3P1A6NDR6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEIS3P1A6NDR6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEIS3P1A6NDR6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MEIS3P1A6NDR6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms