Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC13A5PLN9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC13A5PLN9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC13A5PLN9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms