Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM72A0PK05 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM72A0PK05 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms