Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F8A0AVK6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F8A0AVK6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms