Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1C5

CYP2D7, Putative cytochrome P450 2D7, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2D7A0A087X1C5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP2D7A0A087X1C5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP2D7A0A087X1C5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CYP2D7A0A087X1C5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYP2D7A0A087X1C5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CYP2D7A0A087X1C5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYP2D7A0A087X1C5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYP2D7A0A087X1C5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP2D7A0A087X1C5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP2D7A0A087X1C5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP2D7A0A087X1C5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP2D7A0A087X1C5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP2D7A0A087X1C5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms