Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ARL2-SNX15V9GYD0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ARL2-SNX15V9GYD0 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ARL2-SNX15V9GYD0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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