Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms