Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AC096631.1-202ENST00000440162 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 UCHL1-AS1-202ENST00000510073 451 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AP000944.1-201ENST00000533886 564 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX6Q9UPM6 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms