Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
USP18Q9UMW8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP18Q9UMW8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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