Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PADI1Q9ULC6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms