Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLXNA1Q9UIW2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms