Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms