Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNA3Q9UI47 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms