Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHORDC1Q9UHD1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms