Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HMGXB4Q9UGU5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms