Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFT172Q9UG01 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms