Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HCN3Q9P1Z3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms