Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms