Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DNAJC28Q9NX36 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms