Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf42Q9NWW7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms