Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO28Q9NVF7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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