Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG3Q9NT62 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG3Q9NT62 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms