Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SERINC1Q9NRX5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms