Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PFDN4Q9NQP4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PFDN4Q9NQP4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PFDN4Q9NQP4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PFDN4Q9NQP4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PFDN4Q9NQP4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PFDN4Q9NQP4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PFDN4Q9NQP4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PFDN4Q9NQP4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PFDN4Q9NQP4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PFDN4Q9NQP4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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