Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAT0

ROPN1, Ropporin-1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1Q9HAT0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1Q9HAT0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms