Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A8Q9C0K1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms