Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL4Q9C0H6 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms