Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRP1Q9C000 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms