Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM8Q9BZR9 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms