Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM2Q9BVW6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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