Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP58Q9BVL2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms