Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR3CQ9BUI4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms