Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EBF4Q9BQW3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms