Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms