Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNC2Q96PR1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms