Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDC1Q96MU7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDC1Q96MU7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms