Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNBD2Q96M20 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms